Τεράστια προβλήματα αντιμετωπίζουν οι πλοίαρχοι των πλοίων που καταπλέουν στα ελληνικά νησιά, αφού όπως υποστηρίζουν τα περισσότερα λιμάνια των νησιών είναι φυσικά αγκυροβόλια, που δημιουργήθηκαν στις αρχές του περασμένου αιώνα για να δέχονται καΐκια και πλέον -στην πλειονότητά τους- δεν πληρούν τις προϋποθέσεις για να δεχτούν πλοία 140 μέτρων, αλλά και ακόμη μεγαλύτερων.
Η ανεπαρκής προστασία από τους ανέμους, τα αβαθή νερά που εμποδίζουν τους ελιγμούς, η ελλιπής σήμανση, αλλά και η έλλειψη προσκρουστήρων -για να μη χτυπούν τα πλοία πάνω στις προβλήτες- είναι τα σημαντικότερα προβλήματα που αντιμετωπίζουν τα ελληνικά λιμάνια.
Από αναφέρουν και τα Νέα σύμφωνα με την έκθεση που συνέταξε για το 2012 η Πανελλήνια Ενωση Πλοιάρχων Εμπορικού Ναυτικού είναι πολλά αυτά που πρέπει να γίνουν για αλλάξουν τα λιμάνια και να γίνουν ασφαλή για τους επιβάτες και τα πληρώματα.