'Έφηβος ετών 37. Ο Γιώργος Καραγκούνης απέδειξε για ακόμα μια φορά πόσο πολύ αγαπάει και παθιάζεται για την Εθνική ομάδα. Έτρεξε ασταμάτητα για 120 λεπτά σαν να ήταν παιδί 15 ετών, τα έδωσε όλα και στάθηκε σαν πραγματικός αρχηγός δίπλα στους συμπαίκτες του μετά το τέλος του αγώνα με την Κόστα Ρίκα.
Αυτό ήταν το τελευταίο του παιχνίδι με την γαλανόλευκη. Είναι ο απόλυτος ρέκορντμαν.Το 2004 στέφθηκε πρωταθλητής Ευρώπης με την Ελλάδα στην Πορτογαλία.
Στην πρεμιέρα των αγωνιστικών υποχρεώσεων της Ελλάδας απέναντι στην Πορτογαλία σημείωσε το πρώτο τέρμα της διοργάνωσης με ένα εξαιρετικό σουτ στο 7ο λεπτό, το οποίο εκτίναξε την ψυχολογία της ελληνικής ομάδας που μέχρι τότε αντιμετώπιζε με δέος τις διεθνείς διοργανώσεις και ήταν η αρχή της μετέπειτα θριαμβευτικής πορείας για το πρωτάθλημα Ευρώπης (ήταν τιμωρημένος στον τελικό, όπου η ομάδα του σήκωσε το τρόπαιο νικώντας πάλι τους Πορτογάλους).
Στην αντίστοιχη διοργάνωση του 2012, ο έμπειρος, πλέον, Γιώργος Καραγκούνης αποτέλεσε τον φυσικό αρχηγό του ελληνικού αντιπροσωπευτικού συγκροτήματος. Μάλιστα στον κρισιμότερο αγώνα της φάσης των ομίλων με τη Ρωσία, πέτυχε το μοναδικό τέρμα της αναμέτρησης, δίνοντας τη νίκη - πρόκριση στην Ελλάδα.
Το 1997 κατέκτησε με την Εθνική Ενόπλων το Παγκόσμιο Κύπελλο Ποδοσφαίρου Ενόπλων 1997, ενώ το καλοκαίρι του 1998 ήταν ο αρχηγός της Εθνικής Ελπίδων που κατέκτησε τη 2η θέση στο Ευρωπαϊκό πρωτάθλημα (0-1 στον τελικό με την Ισπανία).